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【中国迷信报】迷信家破译软籽石榴“突尼斯”全基因组暗码

泉源:中国迷信报 作者:李晨 2019-10-09 08:42:00 阅读量:

   

   

   

  吃石榴不吐籽,软籽石榴做失掉!但是,与硬籽石榴相比,国际普遍种植的软籽石榴“突尼斯”不抗冻的特点严峻要挟和限定了财产安康开展。

  克日,Plant Biotechnology Journal在线宣布了中国农业迷信院线赌博平台开户网站研讨员曹尚银课题组完成的软籽石榴“突尼斯”的高质量基因组图谱,为剖析软籽和硬籽石榴种类分解遗传机制提供了支持,并为软籽石榴遗传改进研讨奠基了紧张根底。

  石榴(Punica granatum L.)是一陈旧的落叶灌木果树树种,种植汗青久长。论文通讯作者曹尚银通知《中国迷信报》,石榴被誉为“生命之果”,其果皮、果肉以及种子均含有丰厚的类黄酮、多酚、花青素等抗氧化物质,有利于防备高血脂、高血压、HIV、感染性疾病、冠心病、前线腺癌症等疾病。尤其是软籽石榴种类,籽粒硬度小,食用时易于吞咽,防止了养分的流失;别的,软籽石榴市场售价通常是平凡种类的2~4倍,是广阔果农脱贫致富的良果佳品。

  论文第一作者骆翔博士引见,该研讨基于二代和三代测序取得了软籽石榴“突尼斯”高质量基因组序列,基因组巨细为320.31 Mb,Contig N50为4.49 Mb,正文了33,594个基因。接纳Hi-C光学技能联合遗传图谱将97.76%的序列组装到了8对染色体上。与现有的“泰山红”石榴基因组相比,“突尼斯”多组装出了46.01Mb序列,Contig N50的均匀长度提拔了46倍,在组装完好度及准确度上都失掉了极大地提拔。

  比拟基因组学研讨标明,软籽“突尼斯”基因组和硬籽“泰山红”“大笨籽”基因组间存在着少量的SNP和InDel变异。对26个石榴种类停止群体遗传学剖析标明,软籽石榴群体和硬籽石榴群体间存在着少量的受选择位点。尤其是Chr1上,存在着高达26.2Mb的受选择区段。基因正文信息标明,与基因组变异及选择信号相干的基因潜伏地影响着石榴硬籽和软籽特性分解。

  本研讨失掉了中国农业迷信院科技创新工程以及国度科技根底性任务专项重点项目标赞助。

  相干论文信息:https://doi.org/10.1111/pbi.13260